miércoles, 26 de noviembre de 2014

Cambios génicos como fuente de variación


Chicos:

Seguimos estudiando las fuentes de variación. Esta lectura nos indica cómo es que los cambios en el ADN, pueden hacer la diferencia para las proteínas que codifican.


Mañana realizaremos actividades con esta lectura y la del martes pasado.

Lindo día y nos vemos en clase. =)

Cambios génicos como fuente de variación

Su resumen en el cuaderno.

De la clase anterior tenemos este video sobre la anemia falciforme.


Y para entender el articulo del día de hoy, un video sobre la hibridación de ácidos nucleicos.

Ambos videos tienen información que complementa sus lecturas.

lunes, 24 de noviembre de 2014

Genes y variación (2014)




Chicos después de este super descanso es hora de retomar el curso:


I se encuentra un video que refuerza la última clase y que nos indica cómo es que se lleva acabo el flujo génico. [ El titulo no corresponde, ya que indica que es del proyecto del genoma humano y en realidad muestra la síntesis de proteínas =( ]. Obsérvalo con cuidado y velo las veces que sea necesario para entender los eventos involucrados.


II Tenemos una lectura que nos indica cuales son los fundamentos de la variación. Los ejemplos y ejercicios son muy bonitos. Esta parte para algunos es como un repaso. De no ser así pon mucha atención a la información y trae tus dudas a clase.

Enlace original a genes y variación


III se encuentran los enlaces a las diferentes etapas del ciclo del VIH y cómo es que se puede tener un tratamiento con tres fármacos para evitar su propagación. Sí el enlace está en inglés, pero la información es valiosa y el inglés técnico es realmente sencillo.



Ciclo del VIH: (el enlace es el numero en azul o la dirección completa a la derecha)

0 http://www.cellsalive.com/hiv0.htm
1 http://www.cellsalive.com/hiv1.htm
2 http://www.cellsalive.com/hiv2.htm
3 http://www.cellsalive.com/hiv3.htm
4 http://www.cellsalive.com/hiv4.htm
5 http://www.cellsalive.com/hiv5.htm





Nos vemos mañana en clase.

miércoles, 12 de noviembre de 2014

Naturaleza de la diversidad genética


Chicos:

Tenemos dos lecturas que son la ampliación de conceptos que se vieron en BIología I y II.

Es como un repaso, para ubicar los origenes de la diversidad genética. Pueden hacer su resumen en procesador de textos si les es más facil. Anota tus dudas y crea un glosario con los conceptos nuevos para tí.

Les dejo el enlace original que es del CCH Sur.

Naturaleza de la diversidad genética

Cambios génicos como fuente de variación

Y en nuestra nota de éxito:

Mexicano gana premio por reconstruir la primera computadora del mundo 

Ya lo conocemos. Es investigador en la   Facultad de Matemáticas e Informática de la Universidad Libre de Berlín y quien elaboró el primer automóvil que se conduce sólo =)

lunes, 10 de noviembre de 2014

Elysia chlorotica, molusco fotosíntetico


Chicos:


Lunes de cinito.

Tenemos algunos videos con información muy relevane sobre fotosíntesis. Elabora un guión con el curso de la información y escribelo ya sea en procesador de textos o a mano en tu cuaderno (tiene nueva información sobre plantas C4 y CAM). Escoge un video y compartelo con tu familia. Resalta la importncia de la fotosítesis y escribe en tu cuaderno las impresiones de tu familiar. Papá, mamá, tía o sobrinos, ( no cuenta la mascota de la familia =( )

 Y ya esta aquí la lectura sobre el molusco marino que incorpora elementos fotosínteticos. Te imagina el futuro? Todos verdes y sin hambre. Esa si será una verdadera revolución !! [resumen y resolución de dudas en el cuaderno].

  • Como reflexión general: Que opinas tú de esta situación que esta viviendo el país? Comparte algún editorial o comentario de redes que quieras expresar.





Evolución en acción. El caso de las babosas fotosintéticas
Andrés Romanowski



INTRODUCCIÓN

Simbiosis es un término generalmente aplicado a la cohabitación de dos organismos, mientras que la endosimbiosis se refiere al hecho de que un organismo viva dentro de otro y pueda ser tanto intra como extracelular.

La simbiosis se refiere a asociaciones fisiológicas, temporales o topológicas con destinos ambientales determinados. La simbiogénesis es, por otro lado, un tipo de innovación evolutiva que describe la aparición de un nuevo tejido, órgano, fisiología u otra característica nueva derivada de la asociación simbiótica.
De hecho, las células de todos los grandes organismos son producto de la simbiogénesis.


Al comienzo de toda asociación simbiótica, el organismo de vida libre está contenido por una membrana propia y contiene su propio ADN, ARN, etc. Por ejemplo, los organismos de vida libre (bacterias púrpuras y cianobacterias) que pasaron a formar organelos (mitocondrias y cloroplastos) deben entonces haber empezado su historia de esta manera. Una adquisición de este tipo contrasta fuertemente con las asociaciones cíclicas, que requieren que cada generación vuelva a adquirir simbiontes. En tanto, en el caso de las mitocondrias y los cloroplastos, las organelos pierden su habilidad de vivir fuera de las células, las cuales se vuelven igualmente dependientes de las funciones de aquellas.


Las dos grandes clases de organelos eucariotas: cloroplastos (fotosíntesis) y mitocondrias (respiración aeróbica) comenzaron como eubacterias. Este hecho, ahora indiscutible, ha sido verificado por secuencias de proteínas y ácidos nucleicos y los tipos de eubacterias involucrados han sido identificados. En el caso de la mitocondria, el ancestro correspondía al grupo á de proteobacterias y, en el caso de los cloroplastos, se trató de algunos tipos de cianobacterias, como Synechococcus. Casi todos los eucariotas poseen una o ambas clases de organelos, que son vestigios de antiguas simbiosis permanentes.

En las asociaciones cíclicas, cada miembro atraviesa distintas etapas: reconocimiento de la pareja simbiótica, asociación física, fusión física y mantenimiento precario del estado integrado. La naturaleza transitoria del estado integrado hace que este tipo de asociaciones sean extremadamente sensibles a las condiciones ambientales. Es por ello que los cambios en el medio ambiente pueden provocar la disociación de la simbiosis. En tal caso, los miembros de la simbiosis continúan su ciclo de vida en forma libre. Sin embargo, en etapas posteriores, los individuos pueden volver a integrar una nueva asociación.

Existen muchos ejemplos para este tipo de asociaciones, que fueron descriptas en su mayor parte en estudios botánicos. Las otras asociaciones cíclicas bien conocidas son aquellas que suceden entre animales marinos y su contraparte fotosintética (Tabla 1).

Existe un tipo de asociación muy interesante, el cual entra dentro de los límites de la definición de simbiosis cíclica. Este se da entre babosas marinas del género Elysia y los cloroplastos de algas del género Vaucheria. En este caso, y de ahí lo llamativo, la asociación es entre un organismo eucariota multicelular del reino animal y una organelo de un organismo multicelular de otro reino.

EL GÉNERO Elysia

Muchas de las simbiosis que ocurren entre animales y algas son asociaciones en las cuales el alga reside fuera de las células del animal o dentro de una vacuola. Este no es el caso para algunas babosas de mar del género Elysia, las cuales establecen una relación “simbiótica” intracelular con cloroplastos que extraen de las células de las especies de algas que ingieren y, sorprendentemente, pueden realizar fotosíntesis.

Las babosas juveniles se alimentan particularmente de los filamentos de algas sifonáceas y cromofíticas e incorporan fagocíticamente los cloroplastos intactos en el citoplasma de células epiteliales especializadas que tapizan los túbulos del sistema digestivo.



Durante este proceso, el retículo endoplásmico del cloroplasto (una característica de los cloroplastos cromofíticos) desaparece, dejando plástidos con su membrana externa en contacto directo con el citoplasma animal. Estos plástidos continúan funcionales desde días hasta meses, según la especie de babosa.

La asociación más duradera se da en Elysia chlorotica, que obtiene sus cloroplastos del alga cromofítica Vaucheria litorea, y puede llegar a durar hasta nueve meses. Si tomamos en cuenta que estas babosas viven entre ocho y diez meses, ya sea en condiciones naturales o artificiales, esto resulta sorprendente. Y no sólo son capaces de mantener los cloroplastos, sino que también pueden realizar fotosíntesis. Además, se ha demostrado que estas babosas son capaces de subsistir en condiciones de laboratorio sin comida si tan sólo se les provee una fuente de luz y de CO2, e incluso aumentar su masa, del mismo modo que lo hacen los vegetales y las algas.

Se ha descrito que esta particular simbiosis no es heredable y debe ser reestablecida con cada generación de babosas de mar. Es decir, los plástidos no se transmiten a los huevos.

Videos:
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Lo único malo es de este video es que menciona fase obscura y fase luminosa =(. 
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5.Sí. esta en inglés, pero la información y las imagenes son muy valiosas.

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Sólo por curiosidad, ¿Otros organismos? Y la divulgación científica. Hay que ser un Sr. grande y aburrido?

lunes, 3 de noviembre de 2014

Cempasúchil. Fuente importante de carotenoides

Chicos:

Excelente sus tareas, las estoy revisando y retroalimentando. =)


Para mañana tenemos una lectura una sobre la flor de muertos, que queda muy bien por el tema de pigmentos fotosínteticos y las fechas del 1o y 2 de noviembre. En esta ocasión el resumen en el cuaderno, le puedes agregar las figuras e ilustraciones que lo complementen, busca esas mismas figuras en internet para que te quede muy bien.

Nos vemos mañana.

I.- Cempasúchil. Fuente importante de carotenoides Chi M B, P P Flores, M R Rivera (2002). Cempasúchil. Fuente importante de carotenoides. Ciencia y Desarrollo. 165:20-24

II.- Quieres saber como la industria alimentaria explota los colores en su beneficio? Con esta presentación te darás una idea.

III.- Otros usos del Cempasúchil

Tus comentarios y reflexión en el cuaderno. =)

Sólo por curiosidad: chinitos que venden luteina


domingo, 26 de octubre de 2014

Actividades





Chicos:

Por causas de fuerza mayor, no tendremos clase este martes y jueves. Así que se pueden dormir dos horas más.

Tenemos actividades que se entregarán vía correo o Google docs, para el martes y a más tardar el jueves


  1. Ya esta la presentación de Fotosíntesis en formato Prezi que estamos estudiando, descarguen y véanla por completo. Si tienen algún problema apoyense entre ustedes para checar las soluciones. Son tres post nuevos.
  2. He colocado una lectura sobre la Coenzima Q. realicen su resumen y lo envían por correo con el siguiente título: nombre_apellido_CoenzimaQ.docx  . Busquen la respuesta a la pregunta: Para que realmente es eficaz la Coenzima Q. Es realmente un ejercicio de comprensión de lectura y de entender la pregunta y encontrar su respuesta.
  3. Realicen la búsqueda de un producto que contenga dicha sustancia, mencionen que promueve y coloquen su opinión sobre si creen que será eficaz para dicha situación. Coloquen una foto del producto. Enlace al archivo colaborativo.
  4. Cómo funciona un veneno? Es momento de poder responder esta pregunta a un nivel de proteínas mitocondriales. Para eso tenemos nuestra lectura: Inhibidores de la cadena de transporte de electrones.Envia tu resumen por correo con el siguiente nombre nombre_apellido_inhibidor.docx y aporta un comentario en este foro
  5. Para el futuro, lee el articulo sobre celdas que generan energía y participa en el siguiente foro con tu comentario:
Plazo para esta actividad termina el jueves  a las 13:00 horas

Coenzima Q ¿Eficaz? (2014)

Actualmente encontramos un uso indiscriminado de la Coenzima Q. (ubicala dentro de tu esquema mitocondrial), la cual forma parte de la cadena de transporte de electrones.


Coenzima Q: Recibe el nombre de ubiquinona, Es el único aceptor de la cadena que no está unido a proteínas. Se aloja en la zona apolar de la bicapa lipídica de la membrana interna dentro de la cual se desplaza. Esto se debe a su naturaleza hidrófoba. Actúa como un portador móvil de electrones.
A partir de la siguiente información:

I Indica para que sí es eficaz la Coenzima Q. Realiza una búsqueda en Internet de algún producto comercial que la contenga así como su posible "acción" benéfica. Comenta si realmente puede tener la acción que menciona la publicidad. Esto en el foro que se te indica

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Inhibidores de la Cadena de Transporte de Electrones



Los inhibidores de la Cadena de Transporte de Electrones (CTE) son substancias que se enlazan a alguno de los componentes de la cadena de transporte de electrones bloqueando su capacidad para cambiar de una forma reversible desde la forma oxidada a la forma reducida y viceversa.

Esta inhibición resulta en una acumulación de los componentes en sus formas reducidas antes del punto de inhibición, y la presencia de las formas oxidadas de los componentes de la CTE después del punto de inhibición.


Debido a que en presencia de estos inhibidores no se libera energia, la sintesis de ATP tambien se detiene. Los mas importantes inhibidores conocidos de la cadena de transporte de electrones son el Amital, la Rotenona, el Antimycin A, el Monoxido de Carbono (CO), la Azida sodica y los Cianuros.

Amital, un barbiturato, y la Rotenona, un producto vegetal obtenido de las plantas que se usa como insecticida y  pesticida, bloquean la cadena de transporte electronico entre la NADH deshidrogenasa (Complejo I) y la CoQ.

Como consecuencia, ellos impiden la utilizacion del NADH como donante de equivalentes de reduccion a la cadena respiratoria. Sin embargo, el flujo de electrones que resulta de la reduccion-oxidacion del Complex II no es afectada, ya que los electrones entran en un punto posterior al bloqueo, a traves de la Coenzima Q.

El efecto del Amital ha sido observado in vitro, ya que la intoxicacion con amital y otros barbituratos afecta principalmente al Sistema Nervioso Central al actuar sobre los canales de iones sensibles al GABA, un efecto no relacionado con la accion del amital sobre el Complejo I.

Las intoxicaciones por Rotenona son muy raras. De hecho, algunas tribus humanas solian pescar echando en el agua extractos de raices conteniendo Rotenona, la cual es facilmente absorbible por los peces a traves de las branquias. La rotenona afectaba la cadena respiratoria de los peces y estos morian y flotaban en la superficie. Estos peces eran consumidos posteriormente sin afectar a los seres humanos, ya que los residuos de rotenona en los peces eran absorbidos con dificultad por el tracto gastrointestinal. En aquellos casos en que la rotenona se ha ingerido en forma concentrada,  generalmente irrita severamente las mucosas provocando vomitos. Sin embargo, sus efectos toxicos no deben ser menospreciados.

Es interesante notar que la Rotenona y el MPTP (una neurotoxina), que tambien afecta al Complejo Respiratorio I, cuando se administran de forma intravenosa, causan sintomas y signos muy parecidos a la enfermedad de Parkinson. Estas substancias afectan primariamente a las neuronas de la substancia nigra. Aparentemente la secuencia de eventos es: afectacion del Complejo I, afectacion del metabolismo mitocondrial, acumulacion de radicales libres, muerte celular, liberacion de substancias toxicas y destruccion de otras celulas.

Antimycin A es un antibiotico producido por Streptomyces griseous que ha sido usado como veneno para controlar alguna especies de peces. Antymicin A interfiere con el flujo de electrones desde el citocromo bH en el Complex III (Q-cytochrome c oxidoreductasa).  En presencia de esta substancia, el citocromo bH puede ser reducido pero no oxidado, y consecuentemente, el citocromo c permanece oxidado, al igual que los citocromos a y a3 del Complejo IV.

El monoxido de carbono (CO) es responsable a nivel mundial por mas del 50 % de las muertes por envenenamiento. Es incoloro e inodoro; puede formarse en grandes cantidades como resultado de la ccombustiónincompleta de combustibles: los tubos de escape de maquinarias , hornos, estufas, son fuentes importantes. El cigarro aumenta los niveles de carboxihemoglobina del fumador.  

La intoxicacion por monoxido de carbono causa trastornos en la entrega de oxygeno a los tejidos y en su utilizacion celular. La afinidad de la Hemoglobina por el monoxido de carbono es casi 300 superior a la que tiene por el oxigeno. Un ambiente en el cual hay apenas 100 ppm (partes po millón)d e CO es suficiente para que la formacion de Hemoglobina llegue a 16 %.  La situacion empeora ademas ya que la union de CO a uno de los grupos Hem de la Hemoglobina aumenta la afinidad por el oxigeno de los otros tres grupos Hem de la molecula, por lo cual la entrega o liberacion del oxigeno a los tejidos esta muy afectada. Debido a su alto consumo de oxigeno, el cerebro y el corazon son los organos mas afectados. La mioglobina tiene mas afinidad aun por el CO que la Hemoglobina, por lo que el musculo cardiaco esta severamente afectado y el paciente presenta una marcada hipotension. Como ya fue descrito anteriormente, la intoxicacion por CO es una importante causa de muerte en todo el mundo.

Se ha observado que el estatus clinico de los pacientes no se correlaciona bien con los niveles de carboxihemoglobina, por lo que se considera que aunque la afinidad de los componentes de la cadena respiratoria por el CO es menor que por el oxigeno, la inhibicion de la citocromo oxidasa  por el CO juega tambien un papel en la intoxicacion por monoxido de carbono.  El CO se une a la forma reducida del hierro (Fe ++) de los grupos Hem de la Citocromo Oxidasa.

De una forma opuesta, en el envenamiento por Cianuro la inhibicion de la cadena respiratoria si desempenha un rol primario. La intoxicacion por cianuro es frecuente en pacientes que inhalan humo de fuegos industriales o residenciales. Tambien se ve este tipo de intoxicacion en personas relacionadas profesionalmente con el cianuro o sus derivados en ciertas industrias. El envenenamiento intencional con cianuro puede verse en personas con acceso a estos compuestos. El cianuro afecta a practicamente todas las metaloenzimas,  pero sus principales efectos toxicos derivan de su union al Fe+++ en los grupos Hem de la citocromo oxidasa, inhibiendo el funcionamiento de la Cadena de Transporte de Electrones.

Las Azidas afectan a la cadena respiratoria de una forma muy similar al cianuro, inhibiendo a los grupos Hem de los citocromos en la Citocromo Oxidasa   (Complex IV). Las azidas son usadas en los “airbags”, en la produccion de detonantes (explosivos) y como preservativo del suero y de algunos reactivos quimicos y biologicos. Se han reportado casos de intoxicacion por azida en humanos. 

Como resultado de la accion de cualquiera de estos inhibidores, se detienen las reacciones redox de la cadena respiratoria, no se libera energia, las bombas de protones no funcionan, por lo que no hay protones que regresen a traves del complejo V, y la produccion de ATP cesa.

tomado de: